Musicalen Fun Home handler om grafikeren Alison, som pludseligt mister sin far. Tabet får hende til at grave dybt i hendes fortid for at fortælle historien om den omskiftelige, geniale og enestående mand, hvis temperament og hemmeligheder definerede hendes familie og liv.
Mest hun springer mellem fortid og nutid genlever Alison sin unikke barndom, hvor hun legede på familien Bechdel begravelsesforretning, sin voksende forståelse af sin egen seksualitet og det ubesvarede spørgsmål om sin fars skjulte lyster.